"Persepolis" er fortællingen om den selvstændige pige Marjane der nægter at makke ret. Marjane forsøger gennem sin barndom og ungdom at finde sig til rette med sine omgivelser. Men det er ikke nemt, slet ikke når man vokser op under præstestyret i Iran. Hendes interesse for ABBA og Nike-sko og ikke mindst hendes lyst til at ytre sig over for autoriteter gør, at hun vækker vel meget opsigt.